Phylogenetik und Migrationsdynamik von Yersinia pestis auf Madagaskar
Das gramnegative Bakterium Yersinia pestis ist der Erreger der Pest, einer Zoonose, die durch hämatophage Vektoren (hauptsächlich Flöhe) übertragen wird. Obwohl es sich bei der Pest in erster Linie um eine Nagetierkrankheit handelt, infiziert sie seit Tausenden von Jahren den Menschen und war in der Geschichte der Menschheit für Millionen Todesfälle und mindestens drei schwere Pandemien verantwortlich. Das derzeit am stärksten betroffene Land ist Madagaskar, eine Insel an der Küste Ostafrikas, wo seit 2010 jährlich etwa 400 Fälle gemeldet werden. In diesem Land gibt es zwei Hauptinfektionsherde: einen im zentralen Hochland, einer Gebirgsregion, in der fast jedes Jahr Fälle beim Menschen gemeldet werden, und den anderen in der Küstenstadt Mahajanga.
Die Pest wurde 1902 in Mahajanga eingeschleppt und verursachte Ausbrüche im Jahr 1907 und in den 1920er Jahren. Nach 1928 wurden über sechs Jahrzehnte lang keine menschlichen Fälle mehr verzeichnet, bis die Krankheit im August 1991 wieder auftrat. Bis zum Ende des Jahrzehnts war die Krankheit mit über 1.700 Verdachtsfällen in der Stadt weiterhin stark präsent. Man geht davon aus, dass es sich bei dem Pestherd in Mahajanga um eine echte Wiedereinschleppung der Seuche handelt, die sehr wahrscheinlich aus dem zentralen Hochland stammt. In diesem Projekt setzen wir phylogenetische Methoden nach Bayes ein, die von der Plattform BEAST2 unterstützt werden, um die Migrationsrate und die Anzahl der Migrationsereignisse von Yersinia pestis zwischen den beiden Brennpunkten abzuschätzen und festzustellen, ob die Ausbrüche in Mahajanga in den 1990er Jahren auf eine einzige oder mehrere Einschleppungen zurückzuführen sind.